Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms