Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ccdc115Q8VE99 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ccdc115Q8VE99 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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