Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Fam20bQ8VCS3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Fam20bQ8VCS3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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