Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Vmn1r200Q8R281 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Vmn1r200Q8R281 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Vmn1r200Q8R281 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Vmn1r200Q8R281 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Vmn1r200Q8R281 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Vmn1r200Q8R281 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Vmn1r200Q8R281 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Vmn1r200Q8R281 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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Vmn1r200Q8R281 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Vmn1r200Q8R281 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vmn1r200Q8R281 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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