Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Txndc11Q8K2W3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Txndc11Q8K2W3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms