Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBQ5

Pi4k2b, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2bQ8CBQ5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pi4k2bQ8CBQ5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pi4k2bQ8CBQ5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pi4k2bQ8CBQ5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pi4k2bQ8CBQ5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pi4k2bQ8CBQ5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms