Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ube3dQ8BX13 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ube3dQ8BX13 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ube3dQ8BX13 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ube3dQ8BX13 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ube3dQ8BX13 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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