Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbp9Q8BTS3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms