Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms