Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smoc1Q8BLY1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms