Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ8

Mis18bp1, Mis18-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18bp1Q80WQ8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mis18bp1Q80WQ8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms