Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lamp3Q7TST5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms