Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Clec18aQ7TSQ1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Clec18aQ7TSQ1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Clec18aQ7TSQ1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Clec18aQ7TSQ1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clec18aQ7TSQ1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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