Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAC4

Uncharacterized protein C2orf71 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PAC4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PAC4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q6PAC4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6PAC4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6PAC4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms