Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrig3Q6P1C6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig3Q6P1C6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig3Q6P1C6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig3Q6P1C6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig3Q6P1C6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrig3Q6P1C6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms