Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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