Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms