Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hecw2Q6I6G8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw2Q6I6G8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw2Q6I6G8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw2Q6I6G8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hecw2Q6I6G8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms