Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms