Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Six3Q62233 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six3Q62233 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six3Q62233 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Six3Q62233 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Six3Q62233 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Six3Q62233 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Six3Q62233 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Six3Q62233 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Six3Q62233 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six3Q62233 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Six3Q62233 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Six3Q62233 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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