Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ssr4Q62186 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ssr4Q62186 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ssr4Q62186 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ssr4Q62186 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ssr4Q62186 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ssr4Q62186 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssr4Q62186 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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