Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ltbp3Q61810 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms