Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1aQ61495 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms