Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usf1Q61069 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usf1Q61069 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usf1Q61069 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usf1Q61069 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usf1Q61069 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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