Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms