Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf3Q60765 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atf3Q60765 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms