Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc85aQ5SP85 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms