Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
H2al1nQ497L1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
H2al1nQ497L1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms