Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm648Q3UJ22 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms