Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip13Q3UA06 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms