Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U595 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q3U595 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U595 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U595 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U595 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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