Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms