Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms