Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim43aQ3TL54 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim43aQ3TL54 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms