Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cpne9Q1RLL3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cpne9Q1RLL3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpne9Q1RLL3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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