Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myo3bQ1EG27 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myo3bQ1EG27 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms