Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col19a1Q0VF58 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms