Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Neurl1bQ0MW30 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms