Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NrepQ07475 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NrepQ07475 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms