Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cab39Q06138 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cab39Q06138 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms