Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CkbQ04447 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CkbQ04447 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CkbQ04447 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms