Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RelaQ04207 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RelaQ04207 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms