Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cacna1cQ01815 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms