Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab33aP97950 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab33aP97950 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms