Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cry1P97784 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms