Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
rp9P97762 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
rp9P97762 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
rp9P97762 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
rp9P97762 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
rp9P97762 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
rp9P97762 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
rp9P97762 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
rp9P97762 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
rp9P97762 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms