Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Bop1P97452 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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