Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll3P85442 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms