Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd13P70217 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms