Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Crnkl1P63154 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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